In de hoedanigheid van de functie van rector magnificus van het College van Bestuur van de Erasmus Universiteit Rotterdam is Annelien Bredenoord lid van diverse externe gremia. Hieronder een overzicht daarvan:
- De Raad voor Medische Wetenschappen, Koninklijke Nederlandse Academie van Wetenschappen
- Koninklijke Hollandsche Maatschappij der Wetenschappen
- Rectorencollege Universiteiten van Nederland
- General Assembly Universiteiten van Nederland
- Bestuurlijke werkgroep Leraren Universiteiten van Nederland
- Stuurgroep samenwerkingsverband ‘Samen werken aan een betere aansluiting vo-ho’
- Sectorkamer Hoger Onderwijs
- Stuurgroep Onderwijs en Onderzoek van Universiteiten van Nederland
- Kennis Positie Audit van de Unit Healthy Living van TNO
- Educatieve Alliantie Zuid-Holland
- Koninklijke Nederlandse Academie van Wetenschappen
- Universiteiten van Nederland: bestuurlijk trekker Academische Lerarenopleidingen
- Universiteiten van Nederland: bestuurlijk trekker Wetenschappelijke Integriteit
Deelnemer curatorium van het RCMMH (Rotterdam Centre fort Modern Maritime History)
Lidmaatschappen als hoogleraar:
- Koninklijke Nederlandse Academie der Wetenschappen (KNAW): lid (2022 – heden)
- Koninklijke Hollandsche Maatschappij der Wetenschappen (KHMW): lid (2018 – heden)
- Raad voor Medische Wetenschappen (KNAW): vice-voorzitter (2017 – heden)