De faculteit Erasmus MC wordt geleid door de decaan, die hierbij wordt bijgestaan door de prodecaan Onderwijs en de opleidingsdirecties van de bachelor- en masteropleidingen. Daarnaast biedt het Erasmus MC het gehele spectrum aan medisch-specialistische vervolgopleidingen aan.
De decanen en opleidingsdirecties worden bijgestaan door de afdeling Onderwijs en Studentzaken (O&S).