Promotie R.H.W.E. (Robin) van der Weide

Proefschrift in het kort:

Een gemiddelde cel heeft een celkern die twee tot tien micron groot is—dat is minder dan 1% van een millimeter. Toch past hier twee meter aan DNA. Hoewel dit op zichzelf al een enorme opgave lijkt, zit dit DNA in elk van de miljarden cellen van het menselijk lichaam op dezelfde manier opgevouwen. Deze vouwen (loops of lussen) hebben ook functies in het reguleren van genen en mis-vouwingen kunnen leiden tot verschillende ziektes en ontwikkelingsstoornissen. Voordat we in de toekomst foutieve lussen kunnen opsporen en herstellen, moeten we eerst weten hoe DNA-organisatie geformeerd en onderhouden wordt. Wij laten zien dat een ringvormig eiwittencomplex (Cohesin) een belangrijke rol speelt in de vorming van de organisatie. De formatie van lussen blijkt een dynamisch proces te zijn, waarbij Cohesin steeds op het DNA wordt geplaatst en er weer vanaf wordt gehaald. Hoe langer Cohesin op het DNA zit, hoe langer de lussen worden. Dit heeft grote effecten hebben op andere lagen van gen-regulatie, wat laat zien dat de organisatie die Cohesin veroorzaakt van groot belang is. Met ons experimentele werk  hebben we voor het eerst een hypothese uit 2001 voor de formatie van loops kunnen bevestigen.