In de hoedanigheid van de functie van vicevoorzitter van het College van Bestuur van de Erasmus Universiteit Rotterdam is Ellen van Schoten lid van diverse externe gremia. Hieronder een overzicht daarvan:
- ACCEZ
- SURF
- Stuurgroep Bedrijfsvoering en Financiën van Universiteiten van Nederland
- General Assembly van Universiteiten van Nederland